近年来，日本地铁经常出现乘客挤塞的现象。原因之一可能是由于列车满载率过高，导致乘客难以通过；另一个原因是列车运行时间过长，无法满足乘客的需求。一些车站的设计不合理，也增加了乘客拥挤的可能性。为了缓解这个问题，日本政府正在采取措施，如增加车辆数量、延长列车运行时间等。提高乘客素质也是解决问题的关键，比如鼓励乘客提前购票、排队等待等。
日本民营铁道协会2018年度问卷显示，乘坐日本地铁时，最常见的不舒适行为包括坐姿不当（叉开腿坐、脚碰别人等）、大声说话或打闹以及背包，背包成为最受日本上班族反感的行为，因为它的体积大、占用地铁空间，导致出口和过道拥挤。
这次排行榜发生了变化，第一名不再是坐姿不当，而是背包，这是因为随着社会进步，越来越多的上班族选择背包出行，而这种做法在日本地铁一族中非常受到反感。
日本的地铁系统非常注重细节，从座位的颜色、高度、拉手的设置、休息室的布局等各个方面，都体现了对乘客的关怀，日本的交通设施也非常完善，如免费饮水机、无障碍通道、智能停车系统等，确保了乘客的安全和舒适度。
日本的地铁系统非常人性化，无论是乘客还是工作人员，都非常注重细节和规范。
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