如何利用Primer6.0设计引物?
1.首先,选择目的基因序列,对格式没有要求,只需复制目的基因序列即可。
2.打开File目录下的New,选择Sequence。这里的另一个Project选项是导入文件的方式,即以文件的形式保存目的基因,可以直接导入文件。一般来说,复制更方便。
3.打开Sequence后,会弹出粘贴框,只需粘贴刚复制的基因序列,然后点击下面的Add。
4.选择上面红蓝双向箭头的按钮进行引物设计。设计参数可在设计开始前更改,包括搜索的碱基范围、引物长度、碱基数、设计结果中显示的引物对数等。
5.设置参数后,单击下面的Search,软件开始分析设计,完成后,单击OK。下面将显示设计结果。
6.结果中,蓝色是前引物,红色是后引物。Rating是对引物的综合评价分数,上面也会显示引物的优缺点。最好的是Best,中间的是谷歌,最好的是谷歌。一般来说,引物是Best或谷歌,其他显示器不能使用。
7.右边有两个选项,All Primers可以查看可选的多对不同引物。您可以根据需要选择合适的位置和产品长度。选择后,您需要单击下面的Replace进行更换。
8.All Structers可以查看当前选定的引物结构,如发夹结构、引物二聚体和重复碱基。
9.选择引物后,单击下面的引物序列,然后右键弹出复制信息选项,然后导出设计好的引物。结果也可以以文件的形式直接导出。
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