阿利伯克级驱逐舰是美国海军自冷战以来首次认真考虑船体被动防护的水面舰艇，当时，由于核战争的威胁和制导武器的快速发展，世界各国逐渐放弃了沉重的船体被动防护措施，认为使用防空系统和电子战装置拦截或干扰攻击武器是最好的选择，但在阿利伯克级驱逐舰上，被动防护措施再次被设计为重点。
主动防护是指避免被击中，并在被击中后尽量避免失去战斗力，前者包括降低舰艇本身的信号(如降低雷达截面积、红外信号、噪声等)、加强电子反制措施等，后者在船体重要舱室安装破片防护装甲(伯克级安装了近130吨凯夫拉装甲)、提高材料的耐火性和抗冲击性，加强消防管道设施，分散重要系统(如战斗信息中心)等。
20世纪80年代，美国开始设计阿利伯克级驱逐舰，就在设计的时候，马岛战争在1982年爆发了，包括美国在内的世界各国海军都非常重视这场战争，在这场战争中，英国皇家海军的四艘水面作战舰艇被阿根廷击沉，许多舰艇受伤，在这些被击沉和受创的舰艇上，暴露了许多舰艇防护设计和管道损坏问题，震惊了海军。
谢菲尔德号驱逐舰在马岛战争中被中弹起火，谢菲尔德驱逐舰在不知不觉中被飞鱼反舰导弹击中，虽然导弹的弹头没有爆炸，但其发动机的残余燃料引起了火灾，由于命中部分的关系，谢菲尔德立即失去了电力和消防损坏管道的能力，船舶装饰在设计中没有考虑到防火性能，导致火灾失控，最终不得不放弃船舶，中弹后，英国海军21型护卫舰羚羊号和热情号大火烧到铝合金制成的上层结构，然后火势完全失控，直到整个上层建筑完全坍塌，船体断裂沉没。
这场战争中的许多问题使许多当时正在设计的船只重新设计了保护，阿利伯克级也不例外，美国海军部长立即成立了一个专门研究马岛战争对船舶设计的影响的特别小组，在这种情况下，美国海军修改了阿利伯克级驱逐舰的设计，提高了被动防护能力，例如抗震、抗爆、抗破片、抗电磁脉冲、耐热等方面都有具体要求。
经过研究，美国海军认为，轻质铝合金作为上层结构的主要材料已经过时，以降低船舶的重心，在马岛战争中，几艘英国舰艇沉没的主要原因是使用低铝合金材料，导致火灾迅速扩大到无法控制的范围。
阿利伯克级巴尔克利（DDG-84）
阿利伯克级在材料的选择上下了很大的功夫，大多数船体都是钢制的，不使用木材、易燃窗帘、橡胶地毯等易燃装饰设施，而是使用各种阻燃材料进行装饰，舰内电缆绝缘层采用天然硅橡胶和玻璃纤维编织保护层，提高防火能力，船内舱室还配备了完善的消防设备，战斗信息中心布置在船体中央，周围有许多通道，与过去美国海军的习惯不同，伯克级将信息数据分配到每个舱室（声纳室位于战争中心前），这些设计都是为了提高被动防护能力。
除了提高被动防护能力外，阿利伯克级还考虑在设计阶段降低船舶雷达信号，该级驱逐舰的上层结构完全采用平面和倾斜角度，放弃了容易扩大反射信号的弧边缘或全反射的垂直角，甲板上的各种设备也应尽可能集中或关闭。